7月26日，国家蛋白质科学研究（上海）设施迎来开放十周年。
作为全球首个生命科学领域的综合性大科学装置，蛋白质设施现有九大技术系统，建立了从蛋白质样品制备、结构解析到功能研究的完整技术体系。面向未来，蛋白质设施全面加速传统实验技术与AI技术的深度融合。
国家蛋白质科学研究（上海）设施开放十周年学术论坛。主办方 供图
2010年开工建设，2015年正式开放，蛋白质设施始终面向人民生命健康领域的重大需求，聚焦基础研究、前沿交叉和生物医药产业转化关键环节，持续为生命科学重大科研任务提供高水平技术支撑。
开放十年来，蛋白质设施已服务全国33个省级行政区的504家科研单位（含100多家科技企业），支撑超过2500个研究团队、累计10万余人次用户开展实验研究。设施支撑完成科研课题超13400项，发表高水平研究论文4000余篇，包括《自然》《科学》《细胞》等国际顶级期刊学术论文136篇。
十年来，蛋白质设施作为我国蛋白质科学研究“国之重器”，始终致力于推动蛋白质科学技术的升级与创新。蛋白质设施建设的蛋白质结构数据库，支撑起我国生命科学数据的开放共享，实现了中国机构参与国际蛋白质结构数据库（PDB）建设和管理的“从0到1”突破。截至2025年5月，PDB共收录235666条高质量蛋白质结构数据，其中约10.3%来自中国地区的投递，位于蛋白质设施的中国团队已累计注释审校数据条目超过6000个。
国家蛋白质科学研究（上海）设施
面向人工智能时代的深度演进，科学研究正步入以数据驱动和模型预测为特征的“AI for Science”新时代。蛋白质设施正全面加速传统实验技术与AI技术的深度融合，以智能化、自动化、体系化的技术升级路径，推动核心实验平台向更高通量、更高维度、更强融合的方向演进，打造支撑未来蛋白质科学发展的关键“底座”型科技基础设施，夯实我国在生命科学与生物技术领域的全球竞争力。
应对新一轮科技革命的技术挑战，蛋白质设施正系统布局蛋白质动态结构研究平台建设，着力提升设施整合结构生物学平台实时捕捉动态结构的时间分辨能力，同时引入AI驱动的模拟计算与构象预测技术，推进功能蛋白质动态结构的多尺度、多时间点计算模拟能力。
在合成生物学这一“AI+生物”最活跃的领域，蛋白质设施也正在积极布局智能蛋白质设计与制造平台。结合生物分子结构数据库、AI算法创新和自动化合成技术，设施将对PDBc数据库与计算框架进行升级，并携手康码（上海）生物科技有限公司，联合打造全球首个高通量的“DNA-to-Protein蛋白质体外无细胞合成”智能制造装置。
以结构生物学为锚点，蛋白质设施全面拥抱智能计算、机器学习与高性能模拟技术，推动结构测定与功能设计的深度融合，打造“从结构认知”到“结构创造”的全新国家大科学设施新生态。
面向未来，蛋白质设施将持续锚定国际科技前沿和国家战略需求，着力构建结构生物学与合成生物学交叉融合的技术新体系。设施将聚焦蛋白质动态结构研究这一全球挑战性方向，升级关键实验系统，携手高性能计算平台共建“干湿结合”的动态研究生态，打造支撑新药发现和功能分子设计的基础能力。同时，面向人工智能时代的合成生物学新机遇，设施将推动“蛋白质数据库”与“设计平台智能化重构”，建设全球首个高通量蛋白质“智造”平台，为我国率先占领生命科学技术制高点注入强劲动能。
澎湃新闻记者 蒋乐来
